Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTNNB1P35222 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms