Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNA1P35221 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms