Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TSPOP30536 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TSPOP30536 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TSPOP30536 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TSPOP30536 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms