Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP5F1P24539 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP5F1P24539 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5F1P24539 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5F1P24539 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5F1P24539 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5F1P24539 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5F1P24539 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5F1P24539 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5F1P24539 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5F1P24539 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5F1P24539 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5F1P24539 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5F1P24539 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ATP5F1P24539 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ATP5F1P24539 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms