Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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PDE6DO43924 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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PDE6DO43924 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
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PDE6DO43924 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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PDE6DO43924 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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PDE6DO43924 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PDE6DO43924 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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