Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CCDC78A2IDD5 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms