Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
U3KQV3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
U3KQV3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
U3KQV3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
U3KQV3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
U3KQV3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQV3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQV3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQV3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQV3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQV3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
U3KQV3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U3KQV3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U3KQV3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
U3KQV3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U3KQV3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U3KQV3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
U3KQV3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
U3KQV3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U3KQV3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U3KQV3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
U3KQV3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
U3KQV3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
U3KQV3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U3KQV3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U3KQV3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
U3KQV3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U3KQV3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U3KQV3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U3KQV3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
U3KQV3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
U3KQV3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
U3KQV3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
U3KQV3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U3KQV3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U3KQV3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
U3KQV3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U3KQV3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U3KQV3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U3KQV3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U3KQV3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
U3KQV3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U3KQV3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
U3KQV3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQV3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQV3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQV3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQV3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQV3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQV3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQV3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQV3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
U3KQV3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQV3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQV3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQV3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQV3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQV3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQV3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQV3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQV3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQV3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQV3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQV3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQV3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
U3KQV3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
U3KQV3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
U3KQV3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
U3KQV3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
U3KQV3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
U3KQV3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
U3KQV3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
U3KQV3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
U3KQV3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
U3KQV3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
U3KQV3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KQV3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KQV3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KQV3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KQV3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KQV3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KQV3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
U3KQV3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KQV3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KQV3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KQV3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KQV3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KQV3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KQV3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KQV3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KQV3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KQV3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KQV3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KQV3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
U3KQV3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KQV3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KQV3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KQV3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KQV3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
U3KQV3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms