Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6B7

AP4B1, AP-4 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4B1Q9Y6B7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP4B1Q9Y6B7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
AP4B1Q9Y6B7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP4B1Q9Y6B7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms