Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AUP1Q9Y679 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AUP1Q9Y679 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AUP1Q9Y679 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AUP1Q9Y679 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AUP1Q9Y679 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AUP1Q9Y679 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AUP1Q9Y679 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AUP1Q9Y679 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AUP1Q9Y679 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AUP1Q9Y679 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AUP1Q9Y679 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AUP1Q9Y679 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
AUP1Q9Y679 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
AUP1Q9Y679 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
AUP1Q9Y679 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AUP1Q9Y679 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AUP1Q9Y679 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AUP1Q9Y679 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
AUP1Q9Y679 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
AUP1Q9Y679 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
AUP1Q9Y679 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
AUP1Q9Y679 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AUP1Q9Y679 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AUP1Q9Y679 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AUP1Q9Y679 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AUP1Q9Y679 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
AUP1Q9Y679 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AUP1Q9Y679 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AUP1Q9Y679 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AUP1Q9Y679 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
AUP1Q9Y679 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms