Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G6

PCDHGA7, Protocadherin gamma-A7, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA7Q9Y5G6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA7Q9Y5G6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHGA7Q9Y5G6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.2 ms