Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FARP1Q9Y4F1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FARP1Q9Y4F1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FARP1Q9Y4F1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms