Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRAPPC4Q9Y296 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRAPPC4Q9Y296 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TRAPPC4Q9Y296 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms