Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HIGD1AQ9Y241 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HIGD1AQ9Y241 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms