Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM00

TMCO1, Calcium load-activated calcium channel, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO1Q9UM00 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMCO1Q9UM00 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMCO1Q9UM00 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
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