Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAPPC2LQ9UL33 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC2LQ9UL33 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC2LQ9UL33 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms