Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCSK1NQ9UHG2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCSK1NQ9UHG2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCSK1NQ9UHG2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms