Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL9Q9P2J3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL9Q9P2J3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL9Q9P2J3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms