Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0S2

COX16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX16Q9P0S2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COX16Q9P0S2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COX16Q9P0S2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COX16Q9P0S2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COX16Q9P0S2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COX16Q9P0S2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COX16Q9P0S2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COX16Q9P0S2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COX16Q9P0S2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COX16Q9P0S2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COX16Q9P0S2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COX16Q9P0S2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COX16Q9P0S2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COX16Q9P0S2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COX16Q9P0S2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COX16Q9P0S2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COX16Q9P0S2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COX16Q9P0S2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COX16Q9P0S2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COX16Q9P0S2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COX16Q9P0S2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms