Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU0

FLRT3, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT3, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLRT3Q9NZU0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FLRT3Q9NZU0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FLRT3Q9NZU0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FLRT3Q9NZU0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FLRT3Q9NZU0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FLRT3Q9NZU0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FLRT3Q9NZU0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FLRT3Q9NZU0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FLRT3Q9NZU0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FLRT3Q9NZU0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FLRT3Q9NZU0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms