Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
UBP1Q9NZI7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBP1Q9NZI7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBP1Q9NZI7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms