Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH8

TOR4A, Torsin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR4AQ9NXH8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TOR4AQ9NXH8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOR4AQ9NXH8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOR4AQ9NXH8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms