Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SERINC1Q9NRX5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SERINC1Q9NRX5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2168.5 ms