Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXO6Q9NRD1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FBXO6Q9NRD1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO6Q9NRD1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO6Q9NRD1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO6Q9NRD1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO6Q9NRD1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FBXO6Q9NRD1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO6Q9NRD1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO6Q9NRD1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO6Q9NRD1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO6Q9NRD1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO6Q9NRD1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO6Q9NRD1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO6Q9NRD1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO6Q9NRD1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO6Q9NRD1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO6Q9NRD1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FBXO6Q9NRD1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FBXO6Q9NRD1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms