Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FZD3Q9NPG1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FZD3Q9NPG1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FZD3Q9NPG1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms