Protein–RNA interactions for Protein: Q9H668

STN1, CST complex subunit STN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STN1Q9H668 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
STN1Q9H668 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
STN1Q9H668 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
STN1Q9H668 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms