Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
NBPF3Q9H094 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NBPF3Q9H094 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NBPF3Q9H094 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms