Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX67

JAM3, Junctional adhesion molecule C, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM3Q9BX67 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
JAM3Q9BX67 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
JAM3Q9BX67 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
JAM3Q9BX67 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
JAM3Q9BX67 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
JAM3Q9BX67 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
JAM3Q9BX67 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
JAM3Q9BX67 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
JAM3Q9BX67 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
JAM3Q9BX67 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
JAM3Q9BX67 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
JAM3Q9BX67 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
JAM3Q9BX67 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
JAM3Q9BX67 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
JAM3Q9BX67 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
JAM3Q9BX67 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
JAM3Q9BX67 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
JAM3Q9BX67 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
JAM3Q9BX67 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
JAM3Q9BX67 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
JAM3Q9BX67 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
JAM3Q9BX67 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
JAM3Q9BX67 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
JAM3Q9BX67 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms