Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF4Q9BUZ4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF4Q9BUZ4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRAF4Q9BUZ4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TRAF4Q9BUZ4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAF4Q9BUZ4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms