Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF559Q9BR84 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF559Q9BR84 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms