Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TUBA1CQ9BQE3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.7 ms