Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NPAS2Q99743 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NPAS2Q99743 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NPAS2Q99743 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms