Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NOTCH4Q99466 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NOTCH4Q99466 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NOTCH4Q99466 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms