Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC7Q96M83 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.77
CCDC7Q96M83 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CCDC7Q96M83 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC7Q96M83 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms