Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCHS1Q96JQ0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DCHS1Q96JQ0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DCHS1Q96JQ0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms