Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN0

LCOR, Ligand-dependent corepressor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCORQ96JN0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LCORQ96JN0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LCORQ96JN0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms