Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC97Q96F63 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC97Q96F63 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC97Q96F63 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms