Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFHD2Q96C19 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFHD2Q96C19 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EFHD2Q96C19 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EFHD2Q96C19 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EFHD2Q96C19 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EFHD2Q96C19 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EFHD2Q96C19 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EFHD2Q96C19 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFHD2Q96C19 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFHD2Q96C19 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFHD2Q96C19 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFHD2Q96C19 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EFHD2Q96C19 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFHD2Q96C19 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFHD2Q96C19 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFHD2Q96C19 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFHD2Q96C19 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFHD2Q96C19 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms