Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y2

GTPBP3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP3Q969Y2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GTPBP3Q969Y2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GTPBP3Q969Y2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTPBP3Q969Y2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GTPBP3Q969Y2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTPBP3Q969Y2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTPBP3Q969Y2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTPBP3Q969Y2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTPBP3Q969Y2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTPBP3Q969Y2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTPBP3Q969Y2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTPBP3Q969Y2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GTPBP3Q969Y2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTPBP3Q969Y2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTPBP3Q969Y2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTPBP3Q969Y2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTPBP3Q969Y2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTPBP3Q969Y2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GTPBP3Q969Y2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTPBP3Q969Y2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTPBP3Q969Y2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTPBP3Q969Y2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GTPBP3Q969Y2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTPBP3Q969Y2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTPBP3Q969Y2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTPBP3Q969Y2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTPBP3Q969Y2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTPBP3Q969Y2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GTPBP3Q969Y2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms