Protein–RNA interactions for Protein: Q92393

TY1B-OR, Transposon Ty1-OR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-ORQ92393 DPH6YLR143W 2058 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1B-ORQ92393 ADE3YGR204W 2841 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1B-ORQ92393 BIM1YER016W 1035 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1B-ORQ92393 MTF1YMR228W 1026 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1B-ORQ92393 ETT1YOR051C 1239 nt7.28□□□□□ -1.24
TY1B-ORQ92393 KTR5YNL029C 1569 nt7.27□□□□□ -1.24
TY1B-ORQ92393 RPL14AYKL006W 417 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 UBI4YLL039C 1146 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 NSG2YNL156C 900 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 RRP3YHR065C 1506 nt7.27□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 MSB3YNL293W 1902 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 YLR154W-BYLR154W-B 165 nt7.26□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 TRS23YDR246W 660 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 CTS2YDR371W 1536 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 ESC8YOL017W 2145 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 CLN1YMR199W 1641 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 LUC7YDL087C 786 nt7.25□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 SGE1YPR198W 1632 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 NKP2YLR315W 462 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 YPR071WYPR071W 636 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 TUB3YML124C 1338 nt7.24□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 DAK1YML070W 1755 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 ATH1YPR026W 3636 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 KEX1YGL203C 2190 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 STE50YCL032W 1041 nt7.23□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 CAF4YKR036C 1932 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 SLT2YHR030C 1455 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 ALG6YOR002W 1635 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 MPM1YJL066C 759 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 YNG1YOR064C 660 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 RAP1YNL216W 2484 nt7.22□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 KRE28YDR532C 1158 nt7.21□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 YJL107CYJL107C 1164 nt7.21□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 ECM30YLR436C 3825 nt7.21□□□□□ -1.25
TY1B-ORQ92393 MTR10YOR160W 2919 nt7.21□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 DBP8YHR169W 1296 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 MTM1YGR257C 1101 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 APC4YDR118W 1959 nt7.2□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 ISY1YJR050W 708 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 YMR196WYMR196W 3267 nt7.19□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 LYP1YNL268W 1836 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 AVT4YNL101W 2142 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 GDH2YDL215C 3279 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 RER1YCL001W 567 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 VTS1YOR359W 1572 nt7.18□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 RAT1YOR048C 3021 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 YCR085WYCR085W 354 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 HST4YDR191W 1113 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 YER145C-AYER145C-A 438 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 EDC3YEL015W 1656 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 CUE2YKL090W 1332 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 PRO2YOR323C 1371 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 RAD30YDR419W 1899 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 CBF5YLR175W 1452 nt7.17□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 AIM7YDR063W 450 nt7.16□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 YDR417CYDR417C 372 nt7.16□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 YGR153WYGR153W 654 nt7.16□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 MID2YLR332W 1131 nt7.16□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 GMH1YKR030W 822 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 SED4YCR067C 3198 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 RTC5YOR118W 1704 nt7.15□□□□□ -1.26
TY1B-ORQ92393 API2YDR525W 330 nt7.15□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 DSC2YOL073C 969 nt7.15□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 SNA2YDR525W-A 240 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 TYW3YGL050W 822 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 TAF11YML015C 1041 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 RRN9YMR270C 1098 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 TLG2YOL018C 1194 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt7.14□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 YMR245WYMR245W 621 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 YCR023CYCR023C 1836 nt7.13□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 CLB2YPR119W 1476 nt7.12□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 VHS1YDR247W 1386 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 PHM7YOL084W 2976 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 APM2YHL019C 1818 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 MTC5YDR128W 3447 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 HXT14YNL318C 1623 nt7.11□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 RCR2YDR003W 633 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 MAL13YGR288W 1422 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 MPH2YDL247W 1830 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 GAD1YMR250W 1758 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 CLP1YOR250C 1338 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 ARO80YDR421W 2853 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 ARH1YDR376W 1482 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 VCX1YDL128W 1236 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 IDP3YNL009W 1263 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 RGT1YKL038W 3513 nt7.1□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 SSZ1YHR064C 1617 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 FRA2YGL220W 363 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 AMA1YGR225W 1782 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 BUD22YMR014W 1560 nt7.09□□□□□ -1.27
TY1B-ORQ92393 FAT3YKL187C 2253 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1B-ORQ92393 CBK1YNL161W 2271 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1B-ORQ92393 GLC3YEL011W 2115 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1B-ORQ92393 GSY1YFR015C 2127 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1B-ORQ92393 SUP35YDR172W 2058 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1B-ORQ92393 MET12YPL023C 1974 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1B-ORQ92393 YJL215CYJL215C 360 nt7.08□□□□□ -1.28
TY1B-ORQ92393 ZPS1YOL154W 750 nt7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.8 ms