Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWK9

CKAP2, Cytoskeleton-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP2Q8WWK9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CKAP2Q8WWK9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CKAP2Q8WWK9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms