Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA86

RP9, Retinitis pigmentosa 9 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9Q8TA86 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RP9Q8TA86 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RP9Q8TA86 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RP9Q8TA86 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.2 ms