Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UBR7Q8N806 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBR7Q8N806 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBR7Q8N806 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms