Protein–RNA interactions for Protein: Q86YJ5

MARCH9, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH9, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH9Q86YJ5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH9Q86YJ5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH9Q86YJ5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH9Q86YJ5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH9Q86YJ5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MARCH9Q86YJ5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH9Q86YJ5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH9Q86YJ5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH9Q86YJ5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MARCH9Q86YJ5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH9Q86YJ5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH9Q86YJ5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH9Q86YJ5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH9Q86YJ5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH9Q86YJ5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH9Q86YJ5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH9Q86YJ5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH9Q86YJ5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH9Q86YJ5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MARCH9Q86YJ5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MARCH9Q86YJ5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MARCH9Q86YJ5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCH9Q86YJ5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MARCH9Q86YJ5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms