Protein–RNA interactions for Protein: Q86X19

TMEM17, Transmembrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM17Q86X19 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM17Q86X19 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM17Q86X19 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM17Q86X19 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM17Q86X19 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM17Q86X19 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM17Q86X19 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TMEM17Q86X19 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM17Q86X19 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM17Q86X19 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM17Q86X19 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM17Q86X19 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM17Q86X19 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TMEM17Q86X19 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMEM17Q86X19 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM17Q86X19 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMEM17Q86X19 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM17Q86X19 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM17Q86X19 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM17Q86X19 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM17Q86X19 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM17Q86X19 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM17Q86X19 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM17Q86X19 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM17Q86X19 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM17Q86X19 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMEM17Q86X19 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms