Protein–RNA interactions for Protein: Q86SQ9

DHDDS, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit DHDDS, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHDDSQ86SQ9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHDDSQ86SQ9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DHDDSQ86SQ9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms