Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TMC3Q7Z5M5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TMC3Q7Z5M5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.3 ms