Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDF2Q6PJF5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDF2Q6PJF5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms