Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC70Q6NSX1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC70Q6NSX1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC70Q6NSX1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms