Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM68Q6AZZ1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms