Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC122Q5T0U0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC122Q5T0U0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC122Q5T0U0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms